Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms