Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms