Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stn1Q8K2X3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stn1Q8K2X3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms