Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc3Q8CFZ4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms