Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx8Q8CFD4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms