Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms