Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE72

Jbts17, Protein JBTS17, mousemouse

Predictions only

Length 3,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jbts17Q8CE72 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Jbts17Q8CE72 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Jbts17Q8CE72 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms