Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pramef8Q8CE24 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pramef8Q8CE24 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Pramef8Q8CE24 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms