Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lin52Q8CD94 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin52Q8CD94 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms