Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms