Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Atg4aQ8C9S8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Atg4aQ8C9S8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Atg4aQ8C9S8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Atg4aQ8C9S8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Atg4aQ8C9S8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Atg4aQ8C9S8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Atg4aQ8C9S8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Atg4aQ8C9S8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Atg4aQ8C9S8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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