Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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