Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms