Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms