Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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H2-M10.4Q85ZW8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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H2-M10.4Q85ZW8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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