Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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