Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms