Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Avl9Q80U56 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Avl9Q80U56 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Avl9Q80U56 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Avl9Q80U56 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Avl9Q80U56 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Avl9Q80U56 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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