Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgo2Q7TSY8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms