Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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