Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms