Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms