Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms