Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Senp6Q6P7W0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Senp6Q6P7W0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Senp6Q6P7W0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Senp6Q6P7W0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Senp6Q6P7W0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Senp6Q6P7W0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Senp6Q6P7W0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Senp6Q6P7W0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Senp6Q6P7W0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Senp6Q6P7W0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Senp6Q6P7W0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms