Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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