Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Krt40Q6IFX3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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