Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms