Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pdzrn3Q69ZS0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pdzrn3Q69ZS0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pdzrn3Q69ZS0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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