Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms