Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Znf280dQ68FE8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Znf280dQ68FE8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Znf280dQ68FE8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf280dQ68FE8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Znf280dQ68FE8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Znf280dQ68FE8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Znf280dQ68FE8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Znf280dQ68FE8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Znf280dQ68FE8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Znf280dQ68FE8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Znf280dQ68FE8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf280dQ68FE8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf280dQ68FE8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf280dQ68FE8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf280dQ68FE8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf280dQ68FE8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf280dQ68FE8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf280dQ68FE8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Znf280dQ68FE8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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