Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf4Q64287 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf4Q64287 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf4Q64287 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf4Q64287 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf4Q64287 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf4Q64287 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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