Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ss18Q62280 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.4 ms