Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ecm1Q61508 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ecm1Q61508 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ecm1Q61508 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ecm1Q61508 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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