Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms