Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms