Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms