Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms