Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms