Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc85aQ5SP85 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc85aQ5SP85 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc85aQ5SP85 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc85aQ5SP85 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc85aQ5SP85 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc85aQ5SP85 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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