Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms