Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms