Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim58Q5NCC9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim58Q5NCC9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms