Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3kQ5GIG6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3kQ5GIG6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms