Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spire1Q52KF3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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