Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Carmil2Q3V3V9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms