Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms