Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms