Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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BC051142Q3V0M8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC051142Q3V0M8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC051142Q3V0M8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC051142Q3V0M8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC051142Q3V0M8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC051142Q3V0M8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC051142Q3V0M8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC051142Q3V0M8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BC051142Q3V0M8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BC051142Q3V0M8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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BC051142Q3V0M8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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BC051142Q3V0M8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC051142Q3V0M8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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