Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9Q3V038 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9Q3V038 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9Q3V038 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9Q3V038 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9Q3V038 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9Q3V038 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9Q3V038 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttc9Q3V038 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttc9Q3V038 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttc9Q3V038 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttc9Q3V038 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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