Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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